الدورة تشمل:
المحاضر: عبد الفتاح
Single Cell RNA-seq
تقدّم هذه الدورة شرحًا متكاملًا لتقنية (Single-Cell RNA-seq) بدايةً من المفاهيم البيولوجية الأساسية وحتى خطوات تحليل البيانات واستخلاص النتائج البيولوجية منها.
ستتعلم كيف يمكن دراسة الخلايا بشكل منفصل للكشف عن التنوع الخلوي، والحالات الوظيفية المختلفة، والمسارات الجزيئية المرتبطة بالتطور أو الأمراض داخل الأنسجة المختلفة.
كما تغطي الدورة أساسيات تحليل البيانات الحديثة وكيفية تفسير النتائج البيولوجية وربطها بالتطبيقات البحثية والطبية، مع أمثلة حقيقية من مجالات المناعة والسرطان والطب الدقيق.
مع الكورس
✅ القدرة على تحليل بيانات (Single-Cell RNA-seq) حقيقية خطوة بخطوة.
✅ اكتساب خبرة عملية في العمل الجماعي وتحليل المشاريع البحثية الحديثة.
✅ امتلاك مشروع متكامل قابل للإضافة إلى الـ (CV) وملف (GitHub) البحثي الخاص بك.
بدون الكورس
❌ معرفة نظرية فقط بدون تطبيق عملي حقيقي على البيانات.
❌ صعوبة في فهم خطوات تحليل بيانات (Single-Cell RNA-seq) وربط النتائج بالتفسير البيولوجي الصحيح.
❌ عدم وجود مشروع عملي أو (GitHub Portfolio) يمكن إضافته للـ (CV).
مـــاذا ستحقّـــق بعــد الكـــورس
- 🎯 تحليل كامل لبيانات حقيقية من (Single-Cell RNA-seq) وإنتاج نتائج بيولوجية قابلة للتفسير.
- 🎯 مشروع بحثي متكامل موثق وقابل لإعادة الإنتاج، يشمل الكود وخطوات التحليل على (GitHub).
- 🎯 خبرة عملية حقيقية في تحليل البيانات الحيوية والعمل ضمن فريق بحثي يحاكي بيئة العمل الأكاديمية.
محتــوى الكــــورس
Week 1: Introduction to Single Cell Technology
-
Lecture1: Introduction to Single Cell Technology — Friday | 9:00 AM
00:00 -
Lecture1: Introduction to Single Cell Technology — Friday | 9:00 PM
00:00 -
Practical Tutorial 1: Exploring Single-Cell RNA-seq Workflow — Saturday | 9:00 PM
00:00 -
Practical Tutorial 1: Exploring Single-Cell RNA-seq Workflow — Sunday | 9:00 AM
00:00
Week 2: Quality Control
-
Lecture2: Quality Control — Friday | 9:00 AM
00:00 -
Lecture2: Quality Control — Friday | 9:00 PM
00:00 -
Practical Tutorial 2: Quality Control — Saturday | 9:00 PM
00:00 -
Practical Tutorial 2: Quality Control — Sunday | 9:00 AM
00:00
Week 3: Normalization, Scaling & Highly Variable Genes
-
Lecture 3: Normalization, Scaling & Highly Variable Genes — Friday | 9:00 AM
00:00 -
Lecture 3: Normalization, Scaling & Highly Variable Genes — Friday | 9:00 PM
00:00 -
Practical Tutorial 3: Implementing Normalization & Feature Selection — Saturday | 9:00 PM
00:00 -
Practical Tutorial 3: Hands-on Normalization, Scaling & HVG Analysis — Sunday | 9:00 AM
00:00
Week 4: Dimensionality Reduction, Clustering & UMAP
-
Lecture 4: Dimensionality Reduction, Clustering & UMAP — Friday
00:00 -
Practical Tutorial 4: Exploring Cell Populations through PCA, Clustering & UMAP — Sat | 9:00 PM
00:00
Week 5: Cell Type Annotation
-
Lecture 5: Cell Type Annotation — Friday | 9:00 AM
-
Lecture 5: Cell Type Annotation — Friday | 9:00 PM
-
Practical Tutorial 5: Performing Cell Type Annotation — Saturday | 9:00 PM
-
Practical Tutorial 5: Performing Cell Type Annotation — Sunday | 9:00 AM
Week 6: Cell Communication Analysis
-
Lecture 6: Cell–Cell Communication
-
Practical Tutorial 6: Investigating Cell Interactions Using Communication Networks
🎯Work on real datasets published in recent scientific research studies
🎯 Execute a complete group project for analyzing real biological datasets in a reproducible scientific workflow
🎯 Learn professional GitHub practices, including project organization and repository management
🎯 Gain practical experience simulating real research environments in the field of biological data analysis
🎯 Apply bioinformatics tools and computational approaches to analyze biological datasets and generate meaningful insights
الكــــورس ده لمــــين؟
- طلاب وخريجو التخصصات الطبية والبيولوجية وعلوم الحياة.
- الباحثون والمبتدئون في مجال تحليل البيانات الحيوية والراغبون في دخول مجال (Single-Cell RNA-seq).
- أي شخص لديه اهتمام بالبيانات الحيوية، الطب الدقيق، أو تحليل البيانات البحثية ويرغب في اكتساب خبرة عملية حقيقية.
المحاضــر : محمد عبد الفتاح
- باحث دكتوراه
مهــارات ستكتسبهــا بعــد المســار
آراء بعض الطلاب عن المسار
صراحة استفدت في حاجات كتير أوي وكمان في حاجات كتير مكنتش أعرفها محدش أتكلم عنها قبل كدا ولا حد قدمها بالشكل دا سواء علي مستوي الشرح كان سلسل ومفهوم و المعلومات كانت كويسة أوي بجد يعني طريقة الشرح مفيش حاجة كانت معقدة ومش مفهومة لا كل حاجه متقدمة بشكل بسيط كان قادر يوضح المعلومات بشكل ممتاز ماشاء اللّٰه وطريقة بداية الشرح والاسئلة والتفاعل إنه معتمد علي التفاعل أكتر والتفكير مش مجرد بيقدم معلومات وخلاص، وعلي مستوي تحضير البرزينتيشن اتعلمت حاجات وعرفت الغلط إيه والصح وكسر رهبة عندي شوية وإن شاء اللّٰه يفيدني في اللي جاي تجربة كويسة أوي صراحة.
طالب بكورس الكانسر
جامعة بنها
The lecture was highly effective, especially the interaction and exchange of different viewpoints, followed by the doctor’s corrections, which helped me consolidate information and learn through mistakes. The experience was overall satisfying, as it contributed to gaining information and enhancing knowledge and understanding.
طالب بكورس الكانسر
جامعه القاهره
What I enjoyed most was the clarity of the explanations and the supportive learning environment. The 3 month journey was especially motivating because Dr. Mohamed Abdel Fattah created such an inspiring atmosphere constantly encouraging us with activities like summarizing YouTube courses and keeping us engaged in our studies.
طالب بكورس الكانسر
جامعه القاهره
تنظيم الكورسات تحفه والتسلسل في عرض المحاضرات، حسيت إن المعلومات بتبني فوق بعض تدريجي كدا و اى نقاش خلال المحاضرات فتحت لي زوايا مختلفة للتفكير
طالب بكورس الكانسر
جامعه القاهره